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Tetrapeptidbasiertes Proteindesign

Ein Lösungsansatz für das inverse Proteinfaltungsproblem

Language GermanGerman
Book Paperback
Book Tetrapeptidbasiertes Proteindesign Roman Dallüge
Libristo code: 06916767
Publishers Südwestdeutscher Verlag für Hochschulschriften, November 2008
Die 3-dimensionale Struktur eines Proteins liegt in seiner Aminosäuresequenz verschlüsselt. Das inve... Full description
? points 182 b
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Die 3-dimensionale Struktur eines Proteins liegt in seiner Aminosäuresequenz verschlüsselt. Das inverse Proteinfaltungsproblem beschreibt nun die rechengestützte Suche nach Aminosäuresequenzen, die in beliebige Proteinstrukturen falten können. Ein möglicher Lösungsansatz hierfür ist die Verknüpfung von Peptidfragmenten in ihrer bevorzugten Konformation, die durch wissensbasierte Analysen in Proteinstrukturdatenbanken ermittelt werden. Der Informationsgehalt dieser Datenbanken reicht jedoch für eine statistische Konformationsanalyse längerer Fragmente nicht aus, daher konnte der experimentelle Beweis der Durchführbarkeit eines solchen Modellierungsverfahrens bisher nicht geführt werden. Der Autor beschreibt ein System, das Tetrapeptide in ihrer bevorzugten Geometrie für das Redesign von Aminosäuresequenzen verwendet. Hierfür wurden mit Hilfe eines neu entwickelten Verfahrens zur wissensbasierten Analyse die Strukturen dieser Fragmente untersucht. Die experimentelle Validierung des Systems erfolgte am Beispiel einer artifiziellen Faltungstopologie. Das rekombinant hergestellte Protein M7, dessen Struktur identisch mit dem Modell ist, zeigte die Funktionsfähigkeit des Algorithmus.

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About the book

Full name Tetrapeptidbasiertes Proteindesign
Author Roman Dallüge
Language German
Binding Book - Paperback
Date of issue 2009
Number of pages 184
EAN 9783838108889
Libristo code 06916767
Publishers Südwestdeutscher Verlag für Hochschulschriften
Weight 292
Dimensions 150 x 220 x 11

Categories

Mathematics & Science > Physics > Applied physics > Biophysics
Mathematics & Science > Biology, life sciences > Biochemistry
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